云南完成全球首個(gè)蘭科植物基因組測(cè)序
9月4日上午,云南完成全球首個(gè)蘭科植物基因組測(cè)序科技成果新聞通氣會(huì)在云南普洱市舉行。該項(xiàng)目組用一年半時(shí)間,完成了鐵皮石斛全基因組測(cè)序工作,繪制了國(guó)際上首個(gè)蘭科植物的全基因精細(xì)圖譜。
目前,測(cè)序深度已達(dá)鐵皮石斛基因組大小的200倍,測(cè)序結(jié)果已覆蓋95%的全基因組和97%的基因編碼區(qū),超過(guò)國(guó)際上同行復(fù)雜基因測(cè)序的最高水平。研究組進(jìn)一步解析了鐵皮石斛基因組中的基因信息,發(fā)現(xiàn)了48200多個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,其基因數(shù)目是目前所有已經(jīng)測(cè)序的植物中最多的,從基因水平證實(shí)了鐵皮石斛在植物學(xué)中處于高等植物的地位。
作為聯(lián)盟成員單位的云南農(nóng)業(yè)大學(xué)聯(lián)合普洱市普洱茶研究院,以云南農(nóng)業(yè)大學(xué)盛軍校長(zhǎng)(普洱市副市長(zhǎng))、昆明動(dòng)物研究所王文研究員為課題組組長(zhǎng),全面展開(kāi)了云南鐵皮石斛基因組計(jì)劃的實(shí)施。使用目前最新的第二代測(cè)序技術(shù)和近期剛剛引入國(guó)內(nèi)的第三代單分子測(cè)序技術(shù),完成了鐵皮石斛全基因組測(cè)序工作。
云南農(nóng)業(yè)大學(xué)盛軍校長(zhǎng)表示,鐵皮石斛成為國(guó)際上第一個(gè)擁有基因組精細(xì)圖譜的蘭科植物,也是第一個(gè)進(jìn)行全基因組測(cè)序的藥食同用植物;同時(shí),也是云南省主導(dǎo)完成的第一個(gè)植物基因組。鐵皮石斛基因組精細(xì)圖譜的繪制完成,標(biāo)志著蘭科植物研究進(jìn)入基因時(shí)代,同時(shí)也開(kāi)啟了國(guó)際藥食同用植物基因組研究的新紀(jì)元。
該項(xiàng)目的另一負(fù)責(zé)人王文研究員從基礎(chǔ)研究層面充分肯定了鐵皮石斛基因組的意義,他認(rèn)為,鐵皮石斛基因組作為第一個(gè)發(fā)布的蘭科植物基因組,將為蘭科植物的起源、演化和特性研究提供最基礎(chǔ)數(shù)據(jù),作為第一個(gè)被解析的藥食同用植物基因組,也將進(jìn)一步提振中藥的國(guó)際知名度,促進(jìn)中草藥的現(xiàn)代化。
2012年1月,在云南省科技廳的支持下,云南省成立了石斛產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新戰(zhàn)略聯(lián)盟,并設(shè)立專(zhuān)項(xiàng)經(jīng)費(fèi)開(kāi)展了云南鐵皮石斛地理標(biāo)志研究、云南鐵皮石斛質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)研究、云南省石斛科技產(chǎn)業(yè)發(fā)展規(guī)劃以及鐵皮石斛基因組計(jì)劃等課題。
據(jù)介紹,蘭科植物是在植物分類(lèi)學(xué)中處于最高等地位的一類(lèi)植物,對(duì)蘭科植物的研究被譽(yù)為植物學(xué)研究的“頂峰”。蘭科植物大多屬于瀕危物種,而作為“植物王國(guó)”的云南,匯聚了中國(guó)大多數(shù)蘭科植物。近年來(lái),云南省在蘭科植物的研究、保護(hù)和開(kāi)發(fā)利用方面取得了眾多成果,鐵皮石斛就是其中的代表之一。
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