2006年8月，云南省在大陸地區(qū)率先啟動(dòng)了國(guó)家公園建設(shè)，建立了普達(dá)措國(guó)家公園，綜合效益顯著，引起全國(guó)關(guān)注。2008年6月，國(guó)家林業(yè)局將云南省列為國(guó)家公園建設(shè)試點(diǎn)省。截止2011年底，經(jīng)云南省政府批準(zhǔn)建立的國(guó)家公園已達(dá)8個(gè)（普達(dá)措、麗江老君山、西雙版納、梅里雪山、普洱、高黎貢山、南滾河和大圍山）。實(shí)踐證明，國(guó)家公園是一種能夠合理處理生態(tài)環(huán)境保護(hù)與資源開發(fā)利用關(guān)系的行之有效的實(shí)現(xiàn)雙贏的保護(hù)和管理模式，有利于實(shí)現(xiàn)資源保護(hù)與經(jīng)濟(jì)發(fā)展的和諧統(tǒng)一，有利于滿足人們?nèi)找嬖鲩L(zhǎng)的文化精神需求，有利于樹立云南良好的生態(tài)保護(hù)形象，有利于促進(jìn)我省旅游業(yè)的提質(zhì)增效。

　　七年來，云南省國(guó)家公園建設(shè)取得了值得肯定的成績(jī)，也出現(xiàn)了一些亟待解決的問題，其中首要的就是機(jī)構(gòu)設(shè)置不合理、條款分割嚴(yán)重、管理體制不順的問題。

　　在省級(jí)層面上，省林業(yè)廳在野生動(dòng)植物保護(hù)管理辦公室加掛國(guó)家公園管理辦公室，行使國(guó)家公園管理職能。就目前的機(jī)構(gòu)設(shè)置而言，國(guó)家公園管理辦公室的行政級(jí)別、人員編制、經(jīng)費(fèi)使其協(xié)調(diào)、執(zhí)行能力十分有限，無法對(duì)國(guó)家公園進(jìn)行有效管理。

　　在州市層面上，各州市已自行設(shè)立副處級(jí)以上的國(guó)家公園管理機(jī)構(gòu)，并核定了編制。如普達(dá)措國(guó)家公園管理局為迪慶州政府所屬正處級(jí)參公管理事業(yè)單位，人員編制為20人。而按照省機(jī)構(gòu)編制的相關(guān)管理辦法，副處級(jí)以上的機(jī)構(gòu)的審批權(quán)限在省一級(jí)的機(jī)構(gòu)編制管理機(jī)構(gòu)。同時(shí)，現(xiàn)有國(guó)家公園管理局的內(nèi)設(shè)科室并沒有按照國(guó)家公園的功能來設(shè)置，如普洱國(guó)家公園管理局內(nèi)設(shè)辦公室、保護(hù)管理科、旅游規(guī)劃科、科研所，對(duì)環(huán)境教育、社區(qū)協(xié)調(diào)、游客管理等功能考慮不足。

　　在公園層面上，國(guó)家公園與自然保護(hù)區(qū)交叉或重疊，采用一套人馬、兩塊牌子的形式進(jìn)行管理。普達(dá)措、西雙版納、普洱、高黎貢山、南滾河、大圍山六個(gè)國(guó)家公園均在原有自然保護(hù)區(qū)的基礎(chǔ)上建設(shè)，而梅里雪山國(guó)家公園與國(guó)家級(jí)風(fēng)景名勝區(qū)、國(guó)家森林公園重疊，老君山國(guó)家公園與國(guó)家級(jí)風(fēng)景名勝區(qū)、國(guó)家地質(zhì)公園和森龍森工企業(yè)天然林管護(hù)的區(qū)域交叉。

　　在實(shí)際操作中，往往出現(xiàn)管理上的混亂及交叉，導(dǎo)致有利益大家管、遇難題相互推諉，無法整合管理資源和建設(shè)投資。此外，同一地域不可能采用不同保護(hù)地體系的管理措施、技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)及管理?xiàng)l例（辦法）。